Cuatro jueces federales en lo penal económico tienen causas contra Mario Roberto Segovia. El primero en procesarlo fue el de Zárate-Campana, Federico Faggionato Márquez, que lo consideró "la persona que ejercía el mando, organizaba y financiaba tanto la adquisición de la efedrina como la producción del estupefaciente...", en la causa iniciada por la detección de un laboratorio en Ingeniero Maschwitz, donde fueron detenidos 9 mexicanos.

Luego fue procesado por el juez porteño Marcelo Aguinsky, que lo consideró el proveedor de más de media tonelada de efedrina que llegó a México oculta en un cargamento de azúcar.

Además, el juez Jorge Brugo lo imputó por la maniobra de ingreso ilegal de una camioneta Hummer. Y su colega Ezequiel Berón de Astrada sospecha que proveyó precursores utilizados para la fabricación de armas químicas a compradores de la Triple Frontera. En todas las causas Segovia se abstuvo de prestar declaración.